高飞提醒作为宋希濂集群把握战略方向的沈英雄注意，中国远征军部队在登陆冲绳岛之中暴露出的问题，之前硫磺岛之战宋希濂的两栖陆战集群的陆战师单独作战打得顽强勇猛，但是此番联合指挥作战，步兵师反而连累的陆战师，这让高飞十分的气结，要求各部队立即开始自查自醒，查找问题和原因。
1944年6月5日，在方国忠的特种作战部队完成最后模拟训练，伞兵第七师完成部署集结之后，冲绳岛惨烈至极的战斗也慢慢的落下了帷幕，日军方面军守备司令官小林王道等全体将领剖腹自尽，日军在冲绳岛南与北被分割开的残部发动了玉碎逆袭，也就在同日，山下奉文的主力部队在吕宋岛也发动了规模罕见的大反攻。
黄俊杰期待已久的日军玉碎反击是在凌晨发动的，似乎日本战时大本营刻意协调了冲绳日军与吕宋日军的反击时间，而且还出动了七波共计一百三十架神风特攻战斗机，不过只击伤了一艘美军运输船，其余全部被击落，缺少训练的日军飞行员甚至架机飞行撞击目标都十分困难，更别说在漫天的火力拦阻下冲撞美军战舰了，所以日军将目标选定为防空火力相对比较弱的运输舰，只要不被美军战机拦截击落，撞击运输舰的成功性相对要大一些。
日军在吕宋岛和冲绳岛的反击可以说全部落入了中国远征军的火力反击包围之中，尤其在吕宋岛，炮艇机与轰炸机投下了大量凝固汽油燃烧弹让一片片日军藏身的丛林化为火海，反正也不是中国本土，所以中国远征军在各种武器弹药的使用方面没有半点顾及，一直用弹药量跟日军对话。
日军在冲绳岛的反击只维持的半天，超过二万名日军与其武装平民被歼灭，大批的日军手持绑在竹竿上的刺刀一波一波的对中国远征军阵地发动徒劳的攻击，最终在密集的炮火下横尸遍野，极少数幸存的日军退入山区，更多的日军伤员则被遗弃和集中处理掉了，在一处山谷的洼地中，中国远征军的侦察队带着美国记者发现了一处日军大型野战医院，其中大约有一万五千具左右的尸体，大部分是用手榴弹自杀或者被枪杀，还有一些无法行动的重伤员则是被浇上汽油活活烧死，日军对待战俘非常残忍，对待其自己也似乎也更为残忍，大量的烧死己方的重伤员，这在世界战争史中都是非常罕见的行径。
山下奉文的大反击是被参谋本部都大本营逼出来的，而且对于吕宋之战山下奉文也近乎绝望了，缺粮少弹，医药几乎全无，病倒的官兵超过三分之一，平民死伤更为惊人，如果在拖延下去唯恐坐等全军覆没之嫌疑，让山下奉文无奈的是，他的对手黄俊杰不是正常中国远征军指挥官喜欢出奇制胜冒险的路线，而是中规中矩的重兵集群推进，装甲部队两翼掩护，重炮加炮艇机，一点机会都不给山下奉文，大有将日军围困在北部山区，让其自生自灭。
不过，持续五天的战斗亦让山下奉文的主力部队损失超过四分之三，部队建制被彻底打乱，后续未投入作战的预备队集结地甚至有遭到美军战略轰炸机部队以凝固汽油弹轰炸的惨剧，整整一个步兵联队在几分钟内被彻底歼灭，损失惨重的山下奉文的撤退遭到了二个中国远征军山地步兵师的围追堵截，日军残部不断传来被围歼灭的消息。
相比清剿残寇的黄俊杰，沈英雄与宋希濂将冲绳战役的作战报告整理了出来，日军近二十万守军，面对同盟国方面绝对优势的海空兵力和地面部队，在近乎孤立无援的情况下，坚持战斗二个月有余，显示了日军抗登陆能力之高，战斗意志之顽强，同时日军所采取的战术，也为劣势军队武器装备组织有效的抗登陆战，提供了有益的经验，日军主要凭借坑道、天然岩洞和山地反斜面阵地，尽量削中国远征军的地空火力优势，并积极开展近战、夜战，组织小部队频繁实施猛烈反击，消耗中国远征军登陆部队的有生力量。
虽然冲绳岛的日本守备部队和航空兵力在战役过程中遭受了严重损失，但却为本土防御争取到了宝贵的备战时间，并使同盟国方面深刻意识到对日本本土的登陆将遇到更加激烈和残酷的战斗，不过对于高飞来说，无论多么大的伤亡，中国远征军亦必须登陆日本本土，彻底的消灭日军的抵抗，摧毁日本人的抵抗意志，美国政府方面预计日本政府很可以要采取谈判的策略来投降或者退出战争，而中国方面，尤其是青年军方面却非常坚持登陆日本本土，这让美国方面感到十分难以理解，惊人的消耗甚至百万官兵的伤亡？
中国远征军进攻冲绳过程之中，日本平民在冲绳战役中死伤也非常惊人，开战时冲绳大约有日本平民近五十万人，其中约有五分之四在交战过程中丧生，美国方面的调查数字显示冲绳战役中有三十五万左右的平民伤亡，其中包括被炮火及空袭炸死以及被日军强迫充当士兵战死的，大部分冲绳平民则在日军强迫下集体自杀。
日本大本营命令冲绳当地的学校组织十四岁至十六岁的未满兵役年龄的少年组成铁血勤皇队，进行军事训练，在非常事态时直接编入军队参加战斗，冲绳共计有十二所中学的近二千名少年被强迫志愿加入铁血勤皇队充实到日军部队中参加战斗，其中一半以上约九成人在作战过程中被中国远征军歼灭。
中国远征军在夺取冲绳岛的两个月的激战中，得到了极大的锻炼，尤其是山地作战中地空火力的紧密联系和重炮火力与自行火炮的运用方面，更得到了极大的锻炼，可以说中国远征军参战各部得到了确实有效的实战锻炼，尤其是在战术协同与谐调方面，甚至比美军地面部队要出色得多，在美国陆军的评估报告中这一点也得到了肯定。