秦峰告诉华佗，鼠疫是鼠疫杆菌引起的，所以治疗的药物，就要去抗菌药物中去找。
华佗茫然，道：“主公，属下能力有限，不知那些是抗菌的药物。”
不能怪华佗，汉末这个时代，对于病毒和细菌真的是门外汉。他们都不懂这个，自然不知道那些是抗病毒中药，那些是抗菌的中药。
其实秦峰最初也不懂，但他毕竟有上一世的经历。那时候他老了，舍不得他的老婆孩子和他的国家，他怕死，就要养生保健，记住了许多中药。后来又在后世带了一阵，就能相互印证。
秦峰回忆中道：“我来告诉你，金银花、连翘、大青叶、板蓝根、青黛、马尾连、紫花地丁、蒲公英、穿心莲、四季青、黄柏、黄连、黄芩、马齿苋、白头翁、大蒜、鱼腥草、野菊花、苦参、香大黄、马蹄黄、川军、将军……。”
秦峰一口气说了近百种后世最有效的抗菌中药。
华佗大喜过望，须知中药数千种之多，若不是秦峰告诉他，他根本就不可能准确的找到。
军师们看到华佗露喜，心里多少好了起来。
庞统摸了摸朝天鼻，“以前总感到书本里描述孔孟老庄圣人们神乎其神，无所不知无所不晓，还有些怀疑。吾主，真圣主也。”
“孺子不可教，不知天高地厚，若不是圣人布道，你知道你是人吗？”老贾诩从旁教训道。
庞统一瞪眼，“老家伙，本军师若是不知道，你也不知道。”
“哎呦~！”老贾诩气的胡子哆嗦。
若非秦峰在这里，恐怕是又要打起来了。
秦峰就教导华佗，“这些药，都是疗效显著的抗菌药，要在这些药物中辩论，论证，寻找新的药方。可建立试验机制。”
“主公，何为试验机制？”华佗急忙问道。
秦峰就道：“可招募试验药剂的志愿者，尝试各种新的治疗。病人加以编号，药方加以编号相对应。哪一个编号的病人好转，就说明这个编号的药方有作用，可针对性的更加深入研究。”
华佗大喜，拜道：“主公圣明，我对主公的敬仰犹如滔滔江水连绵不绝……。”老华佗一激动，就感到必须要拍马屁，不让根本无法表达他此刻的心情，可他不会拍，好像从哪里听到过一句，说了一半记不得了。
“又犹如黄河泛滥一发不可收拾。”老贾诩跟了一句。
“对对。”华佗急忙道。
这马屁拍的硬是要得，大厅里终于有了一丝笑意，但很快就没有了。
秦峰就诏令军机处，在军中挑选志愿者，配合华佗的研究治疗。
这时候天已经黑了，但对于秦峰来说，此刻已经没有白天和黑夜的区别，他再次强调了隔离制度，卫生制度的重要性。就令军师们还有华佗，继续展开工作。
军师们出去后，庞统就掐住了老贾诩的白胡子，老贾诩反手就插庞统的朝天鼻。军师们纷纷劝架，要以大事为重，这才作罢。要说二人为何‘成仇’，据传闻庞统科举时候的卷子是老贾诩判的，而庞统一次名落孙山，一次才是二甲头名。其实卷头都是封着得，贾诩根本就不知道那张是庞统的卷子。
秦峰返回了后宅，为了保护孩子们的安全，他只能隔着房门和孩子们说话，他在每一位夫人和孩子们那里逗留，一直到深夜。
“不要害怕，快去睡觉吧，爸爸会一直在门外守着。”秦峰说着善意的谎言，他虽然无法一直在门外，但他的确一直在守护着他的家。
“爸爸，加油，你一定能大败鼠疫的。就像打败那些罗马鬼怪一样！”
秦峰十分担心他的老婆孩子，但凡有一个人若是出事，他恐怕也活不成了。好在至今，没有一位夫人和孩子生病。他十分感谢老天爷照顾，但他又在从科学角度去考虑。
没准他老秦家有免疫力，他的孩子们从他这里继承了免疫系统，没事。而他的夫人们，那也是经常一体化的，没准那啥也能够产生抗体。
古代的防疫条件根本无法和后世相提并论，他和他的夫人们都接触过月英，却是没事。这更加坚定了他老秦家免疫，疾病中总有免疫的人群，这次落在了他的身上，实在是幸运。
到第二天天亮，秦峰就睡了一个时辰。
时间匆匆过，日复一日，距离秦峰实行隔离制度，已经过去了半个月。北方大地上，依旧一片混乱。鼠疫，在不断夺走人们的性命。值得庆幸的是，人们团结在了一起，对抗鼠疫。各地发生了许多舍小家顾大家，舍生忘死的事情。当然，也发生了许多自私自利，反而帮助了鼠疫的事情，这些人，被黑衣卫秘密残酷的镇压了。
公元197年五月十五日，大朝会。
新宫的建设已经停滞，汉献帝只能无限期的在小宫殿里居住。
这时候的汉献帝，恐怕是真心的老老实实坐在皇位上，静听着秦峰说话。百官们毛呆呆的，他们充满了恐惧，其实都不愿意来朝会，生恐聚集被传染。
于是乎，上至汉献帝，下至小官员，全部带着口罩，带着手套。
秦峰反而没有带口罩和手套，他早跟月英接触过了，若是得病也早就得了。汉献帝和百官敬畏的看着他。
朝会上，秦峰再一次强调了隔离制度、卫生制度的严格执行。汉献帝小鸡吃米的点头，恐怕这是他唯一一次真心希望秦峰全权负责，在这种天塌地陷般的形势下，整个朝廷也处在恐慌中，根本不敢面对，好在有秦峰。
“相较于十天前，每日新增病例开始减少，这表明隔离制度开始体现效果，峰值因此过去，鼠疫已经可以有效控制了。”
众人大喜。太常王朗疾步而出，道：“想鼠疫初期，众人束手无策，是丞相力挽狂澜，救国家社稷于水火之中。丞相的大恩大德，吾等永感五内。”说完，王朗纳头便拜。
于是百官拜倒在地，“丞相的大恩大德，吾等永感五内。”
官员中，就马日磾和董承还站着。
国舅董承十分担忧，小声对马日磾道：“马大人，秦峰在这次瘟疫中反而更加积累了威望，这人手段之高，实乃自古以来奸贼之首，当年的王莽都无法和其相提并论。不能任由事情这样下去，在这样下去，秦子进一定会逼陛下让位的。”
“那怎么办？秦峰在朝廷和民间的威望极高，跟董卓他们完全不同。”马日磾毫无办法。
“我有一法，可消灭秦峰。”董承忽有所得，神情变化道。
“是何办法？”马日磾问道。
“就用鼠疫之事……。”
“噤声，下了朝详谈。”马日磾道。(。)