于是一帮子大臣就又开始开始了讨论，每人都把自己的幕僚叫了来一起制定计划，肖峻和王充可就忙多了，众人不停地在问东问西。
两天后，各地的计划终于都完成了，由主兵的，有主商的、有主工的，总之人们从心里都有了一个谱，那就是不能光是看了，要有一个真的东西拿出来才行，要不头上的顶子可就危险了。
山西的计划是：建设从太原到正定和太原到大同的两条铁路；湖北要修建从汉口到北京的铁路，江苏要以上海为龙头，进一步扩大对国外的贸易，多加出口丝和绸；福建以茶叶为主，扩大出口贸易，重建福建水师；陕西要抓紧石油的开发和利用；直隶修建从天津到北京，天津到山海关和京城到河南的铁路，加强北洋水师的战斗力；河南负责把直隶和湖北的铁路连起来。这样一来整个大清的经济方面就要有一个很大有飞跃了。
太后一看非常高兴，这个沉睡了多年的大清就要醒了，经过这一番动作，看哪个列强还敢小看我大清。她就像个小女孩一样抱着肖峻亲了一下，“下面就看你的了，我看你怎样把这台戏唱好。”
“太后，你就瞧好吧，下次你再来山西，我一定让你坐火车来，决不让你再坐马车了。”
各位大臣出发了，每人都拉了两大车的东西。小的有铅笔、望远镜、指挥刀，大的有迫击炮、机枪、步枪，子弹等。
太后和肖峻又回了北京，那儿还有一大堆的事在等着他呢。
他首先到部里看了一下最近的各地情况。
福建方面来报：最近的游击战取得了很大的成绩，消灭了日本人的几次货运船队，以及好几股海盗，日本人的舰队清剿了几次，我们都躲过了，缴获了海盗的十几艘大型的战舰，派出了多股小分队进入日本，也都站住了脚了，台湾的情况也由于你们的胜利而稳定住了。
原来他们听到肖峻的话以后就由高腾云亲自带队出击进行海上游击战，一开始人们不让他去让他在家主持工作，但是这位老人说什么也不愿意，尤其是听到肖峻率领着扬威号奋勇号取得了大胜以后，更是急了眼了，非要自己亲自去不行，他认为肖峻是在抬举他，可是自己也不能不作也点成绩来，表示一下自己的能力呀，于是福建水师就出了海了。
经过几天的了解，知道了敌人的一些行动规律，这时扬威号和奋勇号也归队了，老人一看大喜，决定伏击日军的运输船队，他们来到了日本海军运输船队经常路过的一条航道边，选择了几个小岛屿把军舰分成三部分埋伏下来，两天以后日军的船队过来了，他们当中的几只船冲了出来，他们把自己化装成海盗，在船的前面大旗上画了一个大的骷髅，日军的船队从来没有遇到过海盗，他们把这条水路当成他们自己的家了。
打了几炮以后，日本海军运输队乱成一团，根本就没怎么抵抗就完了，水兵们冲了上去，把日本人全部清理干净以后，他们带着几船的物资回来了。日本人吃了个哑巴亏，根本就没法去找，不知道是谁干的，以后他们就只好是加大了护航的力量。
这一次，高腾云采取了另一种打法，一见他们的船队来了，就出去了一只快艇，日本海军的军舰就追了上去，跟在快艇的后面追击，快艇不紧不慢地在前面跑，日舰气的火上来了，就在后面拼命追过去，高腾云一见，马上就让人抄了敌人的后路，又把敌人的船队给收拾了，杀死的日军士兵全给扔在了大海里。
日军的军舰跟在快艇的后面追了几十里以后，看看是追不上了，又怕让人给抄了后路，回来以后一看，果然是又吃了个大亏，他们护送的船队早就没影了，只有海面上飘浮着一些日军士兵的死尸。日本方面只是认为这是海盗的事，因为福建的海军早就已经被法国人给干掉了，中国方面根本就没有海军存在，所以他们不怀疑是中国干的，只好是继续加大护航的舰队而已。
肖峻马上向福建发报，让他们注意保护自己，小心中了敌人的诡计，要不停地改变作战技巧，一个计不能老是使用，要经常改变才行，这个仗是越打越精的。
北洋水师这边的报告说，敌人吃了亏以后，没有大股的舰队出来，老实多了，估计是在想办法了解我们的新式武器吧。几条主力舰的舰长老是在要求出战，都被压下了，请肖峻定夺。我们也派出了细作深入日本进行侦察，了解他们的下一步行动计划，还有俄罗斯按规定赔偿我们的军舰也到了，共是主力舰三艘，辅助舰七艘，现已编入了北洋水师，开始了正常的训练。请肖大人到北洋水师来看看。
陆军方面朝鲜的驻军也发来了电报，说明日军在朝鲜没有大的动静，自己正在密切关注他们的动向，肖峻严命叶志超，必须严密注视日本的动向，如有问题发生军法从事，肖峻在后世的时候就知道这个叶志超，贪生怕死丢了朝鲜，给甲午中日战争造成了不可弥补的损失，所以对他就是严格命令，不得有一点问题出现。并保他如果对日问题作的好，就保他可以升上官。也不能光是吓唬也要给点想头，并且秘密命令在朝鲜的聂士成，如果朝鲜一但有事，必须自己作主，把叶志超控制起来，这是不得已的作法。但是这个后手是必须要留的。不然到了关键时刻，叶志超一但私自撤兵，整个军事部署被打乱，那样造成的损失可就大了。
肖峻一想也觉得应该到北洋水师去看看了，自从北洋水师重新开始训练以后，再加上李鸿章离任，自己一直还没到天津去过呢，于是通知北洋水师的主力舰队到天津集结，准备去看一下。
肖峻把京城的工作安排了一下，就要到天津去，和太后一说，这个太后又要去，肖峻说，太后要在家里主持大局，不能老是离京啊，要不京城有了问题麻烦就大了。所以就不让她去，可是就个太后却是采取了一个小女孩的作法，身子一扭“人家不愿意嘛。”说着眼泪就要下来了，这事不是去玩去，她可以随便去，这是关系到国家的大事，可不能随便地说去就去呀，可她非要去。肖峻想了一下，决定快去快回，也就可以了。肖峻和王爷商议了一下，召开了各部的会议，让大家作一个五年计划，和当年的计划，这几个新提拔的人倒是好说，他们有热情有干劲，可是手下的人手不够，老人那边是安稳怕乱，守旧，动力不足，要给他们促一把劲才行。定下了任务以后，告诉他们，要不定期地进行检查。
这时肖峻又公开招标，修铁路，北京到盛京的一段由俄罗斯来修，其余的修京汉路、正太路等要招标，英、法、德等国家的大公司都来了，交了定金，领了标书回去通知各有关的人员前来北京。
肖峻和太后出发了，一天就到了天津，然后改成坐军舰到了海上，北洋水师的舰队已在海上列队迎接了，战列舰、巡洋舰、炮舰、供给舰、潜水艇等全来了，各舰鸣放礼炮向肖峻致意，各舰的通讯兵也都向肖峻发来了致敬的信号，到了镇远号上，丁汝昌已和各舰的管带都到了，大家一看还有太后在场，这可是失礼了，太后却是一笑说道：“你们不知道我来，我不怪你们，你们就只管向肖爱卿汇报就可以了，不要管我。”说完自己就和秋月去船头上去看风景了。
肖峻在丁汝昌的带领下到了舰上的大厅里开会，肖峻和大家说道：“弟兄们，我们的海军原来曾经是亚洲第一，现在我们的对手日本，已经超过了我们，他们一直对我们的国家怀有野心，妄想佔领我们的国家，这是我们不能答应的。现在我们已经取得了对日战争的第一步胜利，消灭了他们的第一游击队，现在我们的军舰数量已经超过了他们，那我们就一定要找机会全歼他们。